Кандидат, найденный в ходе исследования

Google DeepMind описала исследовательский сценарий, в котором платформа Google Antigravity помогла найти кандидата в антимикробные пептиды. По данным компании, у него предсказана активность против патогенов, вызывающих инфекции дыхательных путей. Результат пока не подтверждён экспериментально: кандидат проходит лабораторную проверку.

Поиск проводили среди белковых последовательностей Streptococcus pseudopneumoniae. Исследователь задавал направление работы и выбирал, какие данные собирать, а ИИ-агент координировал поиск по базам, анализ структуры и обзор научной литературы. Google утверждает, что такой подход может сократить до одной совместной сессии работу, которая прежде требовала разрозненных инструментов и длительного отбора.

Поиск по неизвестным белкам

Для поиска Antigravity использовала ProtNLM — модель Google, которая предсказывает биологическую функцию по аминокислотной последовательности. Как описывает компания, модель помогает назначать функциональные метки миллионам записей UniProt, в том числе белкам, чья функция ранее оставалась неизвестной. UniProt — открытая база белковых последовательностей и функциональной информации; сведения о ProtNLM опубликованы в её справке.Справка ProtNLM

Антимикробные пептиды, включая бактериоцины, рассматриваются как возможная основа новых средств против бактерий. При этом обнаружение потенциального кандидата не доказывает его эффективность или безопасность: для этого необходимы дальнейшие эксперименты.

Совместный просмотр структуры белка

В том же материале Google представила Biomolecular Structure Viewer — инструмент для просмотра трёхмерной структуры белка внутри Antigravity. По описанию компании, исследователь и агент могут вместе изучать структуру, отмечать отдельные участки и закреплять заметки; действия в просмотрщике синхронизируются с агентом. Структуры можно получать из базы AlphaFold или загружать собственные предсказания.

Google отмечает, что устойчивость бактерий к антимикробным препаратам усиливает потребность в новых терапевтических подходах. Оценка в 10 миллионов смертей ежегодно к 2050 году приводится в связи с этой проблемой в материалах британского правительства, а не как результат исследования Antigravity.Материал о резистентности